L’église paroissiale, dédiée à sainte Marguerite, est située au centre du village de Flaurling. L’édifice, inspiré du classicisme, remplaça une chapelle du 14e siècle. En 1508, la petite église fut agrandie par le curé Sigismund Ris. D’autres transformations furent entreprises en 1574 et en 1750. En 1836, l’église paroissiale et décanale fut encore une fois agrandie. Depuis, l’entrée principale n’est plus du côté occidental mais du côté oriental de l’église. Dans les années 1957/58, l’artiste tyrolien Wolfram Köberl créa une imposante fresque de plafond. En 2010, l’intérieur de l’église fut entièrement réhabilité et rénové conformément aux normes liturgiques. La restauration du clocher et des façades s’ensuivit en 2012.

Chaque année, la sainte patronne de l’église est fêtée le 20 juillet.